熒光定量PCR檢測(cè)出現(xiàn)假陽(yáng)性的常見(jiàn)原因
發(fā)布時(shí)間:2021-08-29 瀏覽次數(shù):4961次
1. 實(shí)驗(yàn)室污染是導(dǎo)致假陽(yáng)性結(jié)果的主要原因
非洲豬瘟野毒感染時(shí)血液和組織中病毒載量非常高,經(jīng)常檢測(cè)到Ct值15左右的樣本。樣本處理和提取的過(guò)程中需要進(jìn)行離心操作,這些高濃度的樣本離心時(shí)容易造成氣溶膠污染。對(duì)于血液和組織樣本,檢測(cè)非洲豬瘟病毒應(yīng)該盡可能減少離心操作,這類(lèi)樣本病毒載量高、樣本較純凈,可以采用免提取檢測(cè)。
實(shí)驗(yàn)室如果長(zhǎng)期檢測(cè)陽(yáng)性樣本,擴(kuò)增產(chǎn)物中高濃度的目的片段很容易擴(kuò)散到空氣中并不斷累積導(dǎo)致氣溶膠污染。
核酸自動(dòng)提取儀可顯著提高實(shí)驗(yàn)效率,然而,養(yǎng)殖企業(yè)實(shí)驗(yàn)室大多使用中小型核酸自動(dòng)提取儀,并且沒(méi)有適當(dāng)?shù)姆牢廴敬胧跇颖咎幚磉^(guò)程中可能出現(xiàn)交叉污染。相對(duì)于氣溶膠污染,樣本處理過(guò)程中交叉污染導(dǎo)致的假陽(yáng)性概率較小。
2. 熒光定量PCR試劑盒污染或者非特異性反應(yīng)
某些試劑盒沒(méi)有在GMP車(chē)間進(jìn)行生產(chǎn),或者GMP車(chē)間生產(chǎn)過(guò)程中車(chē)間潔凈度不夠或人員操作不規(guī)范,在試劑盒生產(chǎn)過(guò)程中可能出現(xiàn)陽(yáng)性核酸片段或者質(zhì)粒污染反應(yīng)體系的情況。
某些試劑盒生產(chǎn)工藝不過(guò)關(guān),可能出現(xiàn)非特異性翹尾現(xiàn)象。
試劑盒中引物、探針等原料品質(zhì)不過(guò)關(guān),質(zhì)量控制不嚴(yán)格,也可能導(dǎo)致非特異性反應(yīng)。
3. 熒光定量PCR儀性能不佳導(dǎo)致翹尾
筆者發(fā)現(xiàn)某些熒光定量PCR儀性能不佳,在反應(yīng)后期出現(xiàn)非特異性翹尾峰。
4. 電壓不穩(wěn)導(dǎo)致的基線不穩(wěn)定
很多養(yǎng)殖企業(yè)將實(shí)驗(yàn)室設(shè)置在豬場(chǎng)附近,使用電源大多是農(nóng)用電,電壓不穩(wěn)定,會(huì)導(dǎo)致擴(kuò)增基線不穩(wěn)定。另外,豬場(chǎng)附近的臨床實(shí)驗(yàn)室停電風(fēng)險(xiǎn)相對(duì)較高。建議這些實(shí)驗(yàn)室配備UPS緊急電源。
5. 樣本或者氣泡干擾
反應(yīng)體系中存在氣泡或者某些樣本含有特殊成分可能干擾實(shí)驗(yàn),產(chǎn)生非特異性擴(kuò)增曲線,這種擴(kuò)增曲線通常不呈現(xiàn)典型的S型擴(kuò)增曲線形態(tài)。